Tuncay Özkan'dan sonra, Balyoz sanığı Çetin Doğan da Avrupa İnsan Hakları Mahkemesi'ne (AİHM) müracaat etti. Karar, "sahte delil" iddialarının sahiplerinin yüzünü fazla güldürmedi. Çünkü AİHM, "manipüle edilmiş senaryo" savını benimsemedi. Tutuklamayı temelsiz ve suçlamaları hukuka aykırı bulmasa, Avrupa İnsan Hakları Sözleşmesi'nin kişi güvenliğini ve özgürlüğünü düzenleyen 5'inci maddesinin ihlâl edildiği sonucuna varırdı. Aksine, tutuklamanın hukuki bir temele, makûl bir gerekçeye ve somut delillere dayandığını belirtti. 13 aydır devam eden tutuklamanın süresini de uzun görmedi. Ayrıca, Türkiye'de iddia edildiği gibi Özel Yetkili Mahkemeler hukuka aykırı bir nitelik taşısaydı, AİHM, bu konuda da görüş bildirirdi. Özel Yetkili Mahkemeleri, Devlet Güvenlik Mahkemeleriyle (DGM) aynı çizgide görüp eleştirenlere, AİHM'nin son kararı bir cevap teşkil etti. AİHM, bünyesinde askeri üye bulunduran DGM'lerin sadece yapısına karşıydı. Avrupa'nın birçok ülkesinde, terör eylemlerini yargılayan İhtisas Mahkemeleri mevcut. AİHM'nin değerlendirmeleri, belki bir nebze, temelsiz iddiaların önünü kesecektir.