Eymür, "devlet- mafya bağlantılarının" bir parçası mıydı? Fatih Altaylı'ya göre "evet"...
Şenkal Atasagun, 8 Şubat 1998'de Mesut Yılmaz hükümeti döneminde MİT Müsteşarı olduktan bir süre sonra, Alaaddin Çakıcı'nın üzerine gitti ve 18 Ağustos 1998'de Çakıcı Fransa'da yakalandı. Fatih Altaylı, Hürriyet'teki bir yazısında, devlet-mafya bağlantılarının tasfiyesi yoluna gidildiğini söyleyerek, Mehmet Eymür'ün Atasagun tarafından görevden alınmasını da, bunun bir adımı olarak gösterdi. Söz konusu iddia üzerine, Mehmet Eymür'ün eşi Janset Eymür, hem kocasını savundu, hem de İnsan Hakları Derneği Başkanı Akın Birdal suikastının azmettiricisi olarak Mehmet Cemal Kulaksızoğlu ile Kaşif Kozinoğlu'nun ismini verdi. Janset Eymür, Kulaksızoğlu'nun, Yavuz Ataç'ın adamı olduğunu, Kaşif Kozinoğlu'nun ise Çin Sincan Bölgesi'nde (Doğu Türkistan) Pekin yönetimine karşı mücadeleyi örgütlediğini söyledi. (Unutmayalım, Yavuz Ataç da MİT adına Pekin'de bulunuyordu) Janset'e göre, Yavuz Ataç ve Kozinoğlu, Şenkal Atasagun'un yakınlarıydı. Atasagun, önemli bir göreve getirdiği Yavuz Ataç'ı, Eymür'e karşı kışkırtmıştı. Neticede, Eymür ile Ataç, Eymür'ün makamında birbirlerini yumruklamışlardı. (Yavuz Ataç'ın Alaaddin Çakıcı'nın da yakını olduğunu bir kenara kaydedelim. Çakıcı, Ataç'ın MİT'te, ağırlığı olan bir göreve getirilmesi için, Anap milletvekili Eyup Aşık üzerinden Mesut Yılmaz'a baskı yapmıştı.)