Kulüp kariyer
Aykut, ilk olarak Samsunspor'da forma giymiştir. 1999-2000 sezonunda, 30 golle gol kralı olduktan sonra 7 milyon dolara Galatasaray'a transfer oldu. Bu kulüpte iki sezon başarılı maçlar çıkarmıştır ve 2000 yılında bir Süper Kupa kazanmıştır. Süper Lig'de bulunduğu süre içinde 188 gol atmıştır ve Süper Lig tarihinin en çok gol atan 7. oyuncusudur. Temmuz 2002'de Serkan Aykut, eski kulübü Samsunspor'la 5+1 yıllık sözleşme imzalamıştır. Son olarak Samsunspor kulübünde kadro dışı kalmıştır ve 2008-2009 sezonunda kariyerini noktalamıştır.
Millî takım kariyeri
Türkiye Olimpik Millî Futbol Takımı ile 1997 yılında oynanan Akdeniz Oyunları katıldı ve final müsabakasında İtalya Olimpik Millî Futbol Takımı'na yenilerek ikincilik kazanan kadroda bulundu.[2]
Başarıları
Millî Takım Başarıları
Akdeniz Oyunları İkinciliği
1997 - Türkiye Olimpik