Futbola 1999 yılında Balıkesirspor'da amatör olarak başlayan Egemen,1999-2001 yılının sonuna kadar Balıkesirspor forması giymiştir. 2001 yılının sonunda Kartalspor'la profesyonel sözleşme imzaladı. 2002-03 sezonunun devre arasında Bursaspor'a transfer oldu. Bursaspor forması altında 2002-03 sezonundan 2007-08 sezonunun sonuna kadar 155 lig maçına çıkıp, 5 gole imza attı. Ayrıca Bursaspor'un kaptanlığını da yaptı.

Yıl sonunda Bursaspor'la sözleşmesi sona eren Egemen Korkmaz; 2008-09 yaz transfer döneminde Trabzonspor'a üç yıllık imza attı. Trabzonspor'a transferinden sonra da Bursaspor'da giydiği; Bursa ilinin plaka kodu olan "16" numaralı formayı giymeye devam etti. Ancak 17 Mayıs 2009'da oynanan ve Trabzonspor'un 1-0 kazandığı Trabzonspor-Bursaspor maçının ardından "16" numaralı formasını çıkarıp tribünlere sallaması ve saha ortasına gidip taraftarlara üçlü çektirmesi; Bursaspor camiasında tepkilere neden oldu.

Trabzonspor'a transfer olduğu ilk yıl, taraftar tarafından yılın oyuncusu seçildi. Teknik direktör Hugo Broos'un Trabzonspor'un başına geçmesi ve sözleşme uzatılmayan kaptan Hüseyin Çimşir'in Egemen'in eski takımı Bursaspor'a transfer olması sonucu, Egemen Korkmaz 2009-10 sezonu öncesi Trabzonspor'un kaptanı olarak ilan edildi. Egemen genç milli takımlar dahil, toplamda 15 kez Türkiye adına forma giydi. A Milli Takım'da 3 kere ilk 11'de şans buldu. Güçlü fizik yapısından dolayı taraftar kendisine "Gladyatör" lakabını uygun gördü. 14 Eylül 2009'da İstanbul Büyükşehir Belediyespor ile oynanan lig maçında "3" gol atarak hatrick yapan savunma oyuncuları arasında yerini aldı.

25 Mayıs 2011 tarihinde Beşiktaş'la 4 yıllık sözleşme imzaladı.

Egemen, kaptanlık yaptığı Bursa ve Trabzon'da 16 numara ile sahaya çıkmıştı. Tecrübeli futbolcu Siyah-Beyazlı kulüple arasında gerilim bulunan Bursa'nın plakası yerine 55 numaralı formayı tercih etti. Beşiktaş'ta çok başarılı bir sezon geçiren Egemen Korkmaz, 36'sı ligde olmak üzere toplam 50 karşılaşmada forma giydi. Toplam 4 gol atarken 15 sarı, 1 kırmızı kart gördü. 2 Haziran günü gelecek kaygısı nedeniyle BJK'den ayrıldı. 4 Haziran 2012'de Fenerbahçe'ye transfer oldu.

4 Temmuz 2012 tarihinde Fenerbahçe Kulübü, Egemen Korkmaz ile 3 yıllık sözleşme imzaladı. Sözleşme kapsamında oyuncuya verilecek yıllık garanti ücret 1 milyon 750 bin Euro, maçbaşı ücret ise 15 bin Euro olarak açıklandı.

Fenerbahce'deki ilk maçına Sampiyonlar Ligi eleme maçı olan FC Vaslui karşısında çıktı. UEFA Avrupa Ligi'nde AEL Limassol karşısında 1 gol atarak takımının 3 puan kazanmasını sağlamıştır. Aynı zamanda 25 Nisan 2013 UEFA Avrupa Ligi yarı finalinde Benfica'ya gol atmıştır.

Eşi Ezgi Korkmaz ile boşanan Egemen Korkmaz'ın, Ezginaz Korkmaz adında bir kızı ve Ege Korkmaz adında bir oğlu vardır.