Ali Şen: 1981-1983 ve 1994-1998 yılları arasında Fenerbahçe başkanlığı yapmıştır. Taraftarlar onun için “Ali Şen başkan, Fenerbahçe şampiyon” sloganını yazmıştır. Sadece Fenerbahçe değil Türk futbolunun en renkli isimlerinden biridir. Türkiye Ligi’ne birçok yıldızı Fenerbahçe forması altında getirmiştir. Başkanlığının ilk senesinde (1980-81 sezonunda) 1978'den beri şampiyon olamayan bir takım devralmış, o sezon da şampiyonluktan kopan takım son 3 maçını yitirerek 10. sıraya kadar gerilemiştir. Küme düşme potasındaki takımların hepsinin son 3 maçlarını kazanmalarıyla Fenerbahçe ligi biri küme düşen beş takımla aynı puanda bitirmiş ve rakip taraftarların "averajla kümede kaldı" yakıştırmalarına maruz kalmıştır. İddialı transferlerle 1981-82 sezonuna giren Fenerbahçe, Donanma Kupası, Westphalia Kupası ve Hürriyet Gazetesi Kupası şampiyonluklarına ulaşmış. 1982-83 sezonunda ise fırtına gibi eserek hem ligi hem de kupayı kazanmıştı. Ayrıca TSYD Kupası, Donanma Kupası ve Çalenç Kupası'nı da alarak 1967-68 sezonundaki "bir sezonda beş kupa" rekorunu egale etmiştir. Ali Şen 1983-84 sezonunda da takım liderken 10 Aralık 1983'te istifasını vererek görevini sonlandırmıştır. Ali Şen'in ikinci başkanlığı da Fenerbahçe'nin daha önce karşılaşmadığı sıkıntılı bir döneme denk gelmiştir. Üst üste en çok dört sezon şampiyonluk göremeyen kulüp, 1989'dan sonra ilk kez şampiyon olamadan beş sezonu geride bırakmıştı. Formda başladığı 1994-95 sezonunda da arka arkaya aldığı 3 yenilgi ve 2 beraberlikle şampiyonluk yarışına daha ilk yarıda havlu atmış, ayrıca UEFA Kupası'na da 1. turda Fransız temsilcisi Cannes'a 0-4 ve 1-5'lik yenilgilerle veda etmişti. Başkan Hasan Özaydın'ın istifasını müteakip, 18 Aralık 1994'te düzenlenen olağanüstü kongrede Ali Şen başkanlık yarışını kazanmıştır. O dönemde her başarısız sonuçtan sonra Fenerbahçe taraftarının attığı “Ali Şen başkan, Fenerbahçe şampiyon” sloganı Ali Şen'e müthiş bir kamuoyu desteği kazandırmış, bu sayede Şen daha önce iki kongrede seçilmesine engel olan grupların da kerhen desteğini alabilmiştir. 1995-96 sezonunda Fenerbahçe 1989'dan beri ilk şampiyonluğuna ulaşmış ve yine o sezondan beri ilk kez Türkiye Kupası'nda final oynamıştır. 1995-96 sezonunun sonunda ise kulübün efsane isimlerinden Aykut Kocaman ve Oğuz Çetin'in takımla ilişiğini kesmiştir. 1996-97 sezonunda ligi üçüncü sırada bitiren takım sadece şampiyon takımların katıldığı son Şampiyonlar Ligi'nde gruplara kalmış, 6 maçta 2 galibiyet ve 1 beraberlikle o zamana kadar bir Türk takımı için rekor olan 7 puanla grubu 3. bitirmiş ve son maçta çeyrek finale kalma şansını kaçırmıştı. 40 yıldır kendi sahasında (Old Trafford) yenilgi görmemiş Manchester United'ın 30 Ekim 1996'da Fenerbahçe tarafından 1-0 yenilgiye uğratılması ve bu unvanını yitirmesi de Türk futbol tarihinin en önemli maçlarından biri olarak tarihe geçmiştir. Ali Şen ve yönetimi o dönemde yabancı kısıtlaması (o dönemde 3+1 idi) ve hakem hataları nedeniyle sık sık Türkiye Futbol Federasyonu ile karşı karşıya gelmiştir. Ali Şen, grupların Fenerbahçe kongrelerindeki hegemonyasını kırmak için de kulübün tüzüğünün değiştirilmesi ve üye sayısının artırılması için büyük çabalar sarf etmiştir. Kulübün amatör branşları da Ali Şen döneminde başarıdan başarıya koşmuş, basketbol takımı Türkiye Ligi'nde final, Avrupa Koraç Kupası'nda çeyrek final oynamış, voleybol hariç diğer branşlar Türkiye şampiyonluğuna ulaşmış, ayrıca 1998'den itibaren Türkiye şampiyonluklarına ambargo koyacak yüzme takımı kurulmuştur. Ali Şen ve yönetim kurulu 15 Şubat 1998'de futbol takımı liderken olağan kongre ile yönetimi devretmiştir.
Fikret Arıcan: 1984-1986 yılları arasında Fenerbahçe başkanlığı görevini üstlenmiştir. Döneminde Fenerbahçe futbol takımı 1984-85 sezonu şampiyonluğunu, 1984 ve 1985 Cumhurbaşkanlığı Kupalarını, 1985 TSYD Kupası'nı ve 1984 ve 1985 Donanma Kupaları'nı kazandı. Avrupa Kupaları'nda 1985-86 sezonunda ASALA terörü nedeniyle Fransa ile ilişkilerin gergin olduğu dönemde bu ülkenin şampiyonu Bordeaux'yu eleyerek sükse yaptı.
Tahsin Kaya: 1986-1989 yılları arasında Fenerbahçe'ye başkanlık yapmıştır. Onun zamanında Fenerbahçe 1986-87 sezonunda 5. 1986-87 sezonunda 8. olmuştur. En dikkat çekicisi olan son sezonunda takım 103 gol atarak bir rekora imza atmış ve şampiyonluğa ulaşmıştır. Tahsin Kaya zamanında Branko Stankovic, Yılmaz Yücetürk, Birol Pekel, Pál Csernai ve Todor Veselinovic teknik direktörlük yapmıştır.
Metin Aşık: Metin Aşık 1989-93 yılları arasında Fenerbahçe'de başkanlık yapmıştır. Onun döneminde Fenerbahçe 1989-90 ve 1991-92 sezonlarında 2. 1990-91 ve 1992-93 sezonlarına 5. olmuş, 1990 yılında Beşiktaş'ı 3-2 yenerek Cumhurbaşkanlığı Kupası'nı kazanmıştır. Tanju Çolak, Engin İpekoğlu, Semih Yuvakuran, Candido Gerson ve Dzoni Novak gibi yıldızları Fenerbahçe'ye transfer etti. Futbol takımı döneminde şampiyonluktan uzak kalırken, önemli galibiyetlere imza attı. Galatasaray'a karşı 3 sezonda 3 kez 5 gollü galibiyet, UEFA Kupası'nda iki kez ikinci tura yükselme, Harald Schumacher'in jübilesinde Bayern Münih'e 3-2'lik galibiyetler bunlardan en önemlileri. Bunun yanında Fenerbahçe’nin en ağır yenilgileri de Metin Aşık zamanında yaşandı. Kendi sahasında Aydınspor'a 6-1, Beşiktaş'a 5-1, Galatasaray, Beşiktaş ve Sarıyer'e 4-1, Avrupa Kupaları'nda Slovak Sigma Olomouc'a 7-1 gibi. Basketbol takımı ise 1990-91 sezonunda Deplasmanlı Lig tarihinde ilk kez şampiyonluğa ulaştı. Ayrıca 1990 ve 1991'de iki kez Cumhurbaşkanlığı Kupası'nı kazandı.
Güven Sazak: 1993-94'te Fenerbahçe'de başkanlık görevini yürüttü. Fenerbahçe futbol takımı onun döneminde 1993-94 sezonunda bir puan farkla ikinci oldu, ayrıca 1993 yılında Trabzonspor'u uzatmada 1-0 yenerek Başbakanlık Kupası'nı kazandı. Sazak, 20 Nisan 1994'te başkanlık görevini sağlık sorunları nedeniyle bıraktı.
Hasan Özaydın: Özaydın, çok kısa bir süre 1994-95 Sezonunda Fenerbahçe başkanlığı yapmıştır. Yerine Ali Şen'in başkanlığa seçilmiştir.Özaydınlı ayrıca Çengelköyspor'un onursal başkanıydı
Aziz Yıldırım: 1998 yılından beri Fenerbahçe Spor Kulübü’nün başkanlığını yapan ve şimdiden kulüp tarihine adını altın harflerle yazdırmış efsane başkandır. Aziz Yıldırım döneminde kulüp büyük bir atılım yapıp çok güçlü bir ekonomik yapıya sahip olmuştur. Şükrü Saracoğlu Stadı’nı büyülterek Avrupa’nın en önemli statlarından biri haline getirmiştir. Tesisleşme adına büyük aşamalar kaydedilmiş, modern bir stat dışında aynı Avrupa standartlarında da tesislere Yıldırım zamanında sahip olunmuştur. Fenerbahçe’nin bir marka haline gelmesinde büyük bir paya sahip olan Yıldırım Fenerium, Fenerbahçe Televizyonu, gazetesi, radyosu ve dergisini kurmuştur. Aziz Yıldırım döneminde gerçekleşen bu ekonomik büyüme birçok yıldızın da Fenerbahçe forması giymesini sağladı. Nicolas Anelka, Stephan Appiah, Roberto Carlos, Milan Rapaic, P.V. Hooijdonk, Keneth Anderson, Ariel Ortega, Haim Revivo, Daniel Guiza ve Alex de Souza bu isimlerden sadece bazıları. Bu ekonomik güce oranla sportif başarının futbol ayağında istenen seviyeye tam olarak gelindiği söylemese de Fenerbahçe futbol takımı 4 kez şampiyon oldu. İki kez de şampiyonluğu son maçta kaybetti. 100. Yılda gelen şampiyonluksa bunlar arasında en önemli olanıydı. Yıldırım döneminde amatör branşlarda da birçok yıldız Türkiye’ye geldi. Sayısız şampiyonluk ve başarıya imza atıldı.
