Şampiyonlar Ligi'nde Galatasaray'ın çeyrek finaldeki rakibi İspanya temsilcisi Real Madrid oldu.
İsviçre'nin Nyon şehrinde çekilen kurada Galatasaray ilk maçını 2 ya da 3 Nisan'da deplasmanda oynanacak.
Şampiyonlar Ligi'nde ilk maçlar 2-3 Nisan 2013 tarihlerinde oynanacak. Rövanş karşılaşmaları ise 9-10 Nisan 2013 tarihlerinde gerçekleşecek, 23-24 Nisan 2013 ve 30 Nisan-1 Mayıs 2013 günlerindeki yarı final maçlarının ardından 2013 UEFA Şampiyonlar Ligi final maçı 25 Mayıs 2013 Cumartesi günü Londra'nın Wembley Stadı'nda yapılacak.
UEFA Şampiyonlar Ligi'nde son sekize kalan takımlar arasında FC Barcelona, Bayern Münih ve Real Madrid, grup aşamasına birinci torbadan katılmıştı. İkinci torbadan kura çekiminde yer alan takımlardan hiçbiri son sekize kalamazken üçüncü torbadan Paris Saint-Germain, Juventus ve Galatasaray, çeyrek finale yükselme başarısı gösterdi. Dördüncü torba takımlarından Malaga ve Borussia Dortmund ise turnuvada son sekizi tamamladı.