Cumhurbaşkanı Sezer'le ilgili inceleme Gölbaşı'nda villa aldığı haberlerinden sonra başladı. Başbakan Erdoğan, CHP lideri Baykal, DYP, Anavatan ve MHP genel başkanlarının sorgulaması ise geçen yıl başındaki malvarlığı tartışmaları sırasında yapıldı. Erdoğan'ın hisselerini sattığı Emniyet Gıda, İhsan Gıda da vergi, ortaklık yapısı yönüyle defalarca sorgulandı. Genelkurmay Başkanı Org. Yaşar Büyükanıt'ın mali bilgileri ise Şemdinli iddianamesi hazırlanırken Mart 2006'da elde edildi. Başbakan Erdoğan'ın İstanbul üzerinden, Genelkurmay Başkanı Org. Büyükanıt'ın ise İstanbul Hocapaşa, Gayrettepe ve Ankara-Ulus vergi daireleri üzerinden incelendiği anlaşıldı. Cumhurbaşkanı, Başbakan, parti liderleri ve Genelkurmay Başkanı- 'nın mükellefiyet bilgileri, sicil detayları, her türlü mal edinimleri, Motorlu Taşıtlar Vergisi, trafik cezası ödemeleri, başkaca ceza alıp almadığı sorgulandı.
Programı silmişler
Bu arada Maliye Teftiş Kurulu'nun, VEDOP sistemine kimlerin, hangi tarih ve saatte girdiğine ilişkin otomasyon kayıtlarını gösteren programının bir süre etkisiz hale getirildiği ve usulsüz araştırmayı yapanların gizlenmeye çalışıldığı da belirlendi. Ancak, ana bilgisayardaki kayıtların silinmediği görüldü. VEDOP sistemine giriş yapanlara özel bir şifre verildiği ve şifre sahibinin kimliğinin hemen deşifre edildiği kaydedildi. Teftiş Kurulu Başkanvekili Boyalı başkanlığındaki 6 kişilik heyet, 2006'da kimin hakkında, ne zaman, ve hangi amaçla sorgulama yapıldığını araştırırken çarpıcı sonuçlara ulaştı. Teftiş Kurulu'nun yanı sıra 70 ildeki çeşitli vergi dairelerinden VIP kişilerin bilgilerine defalarca girildiği saptandı. Cumhurbaşkanı Sezer için de 50 defa sisteme girildi.