Mustafa Balbay, 28 Şubat sürecinden beri siyasete müdahale eden ve hazırlıklar yapan askerlerle iç içe. Onun, Çetin Doğan'a ilişkin tuttuğu notlar şöyle:
"O hazır... Ameliyattan hemen önce, İzmir'de ordu komutanlarıyla konuşmak, toplanmak üzere hazırlık yaptı; konuşmasını hazırladı. Bunu bilgi olsun diye Genelkurmay'a gönderdi. Yaşar Paşa (Büyükanıt) bir üste iletmedi. Türkiye böyle gitmez, hükümet bu işi götüremiyor türündeydi. Kesin konuşmayı yapacaktı. Aytaç Paşa (Yalman) yap demiş."
Çetin Doğan, 31 Mart 2003'te bypass ameliyatı geçirdi. Balbay o günü günlüğünde şöyle anlatıyor: "Mehmet Beyle görüştüm. Çetin'in ameliyat olmasının nedeni hazırlık; o güne hazırlanıyor. Röportajda (Aktüel'deki) sürekli ben emekli olacağım demesinin nedeni, bazı dedikodular çıktığı için kimseyi ürkütmemek. Ama fazla emekli olacağım dedi."