Org. Bilgin Balanlı'nın tutuklanması, kimilerini şaşırttı. Ama olayları yakından izleyenler, bu gelişmeyi tahmin ediyordu. Balanlı Paşa'nın ismini, ilk defa Mart ayında, emrindeki Tümgeneral Ahmet Yavuz'a gönderdiği bir talimat vesilesiyle duyduk. Tümgeneral Yavuz, komutandan aldığı emir gereği, "Harp oyunu ve plan semineri belgelerinin bilgisayarlardan yok edilmesini" istemiş, "Arşiv işlemleri yapılırken, imha edilen arşivlik malzemenin ayrıca bilgisayarda bulunan elektronik halleri de silinecektir" yazısını tüm askeri birimlere göndermişti. Tümgeneral Yavuz'un imzası bulunan emir 27 Ocak 2011 tarihini taşıyordu. Zaten Yavuz, bu tarihten 15 gün sonra Balyoz davasından tutuklandı. Gene Balyoz'dan tutuklanan Korgeneral Yurdaer Olcan da, Harp Akademileri Komutanı Org. Bilgin Balanlı'nın yardımcısıydı.
Gölcük Donanma Komutanlığı'nda İstihbarata Karşı Koyma Birimi'nin parkelerinin altında ele geçen evraklar arasında, Bilgin Balanlı adına imzaya açılmış belgeler vardı. Şubat 2003 tarihli çok gizli emirde, "Oraj hazırlıkları kapsamında yapılan tüm çalışmalar EK-A'da sunulmuş olup, ilgili personele devredilmiştir. İhtimalat Planı hazırlanmasına yönelik olarak Planlama Grubu oluşturulmuş olup, faaliyetler gizlilik içerisinde yürütülmektedir. Arz ederim" (Hava Pilot Tümgeneral Plan Prensipler Başkanı Bilgin Balanlı) yazıyordu. Belgenin ekleri şu şekilde belirtilmişti: "EK-A: Oraj Hava Harekât Planı Devredilen Çalışmalar. EK-B: İhtimalat Planı Hazırlıklarında Görev Alacak Personel Listesi."
Daha sonra Eskişehir'de, emekli Albay Hakan Büyük'ün evinde çıkan evrakın, İhtimalat Planı'nın devamı niteliğinde olduğu ileri sürüldü. Oraj'ın uygulanamaması, ya da başarısız kalınması durumunda alınacak tedbirlerle ilgili bir planın, Balanlı tarafından hazırlandığını gösteren yazışmalar ele geçti. Bunun yanı sıra, gizlilik ihlâli yapan personelin doğrudan Tümgeneral Bilgin Balanlı'ya bildirilmesini isteyen bir talimat da belgeler arasındaydı.
Emekli Albay Hakan Büyük'ün evinde, Bilvanis Operasyonu'na ilişkin bilgilere de rastlandı. 2003'ten itibaren, tarikatçı yapılanma iddiasıyla ilgili bu çiftliğin yakından izlendiği, fotoğraf ve videolarının çekildiği anlaşıldı. Bilgin Balanlı, 2006-2009 arasında 1. Hava Kuvvetleri Komutanı sıfatıyla Eskişehir'de bulunuyordu. Hakan Büyük'ün evinde çıkan belgeler arasında, Bilvanis Çiftliği'ne gerektiğinde taarruz edileceğine dair bir yazı da mevcuttu. Bilgin Balanlı imzasıyla açılan Şubat 2007 tarihli belgede şu 2 madde yer alıyordu:
