Hükümete açtığı savaşta, muhalif olarak gördüğü herkesi yabancı ya da terör örgütü demeden işbirlikçisi yapan Doğan, Yeni Türkiye'nin temellerine dinamit sokmaya kalkışan herkese kol kanat gerdi. Bu güçlü ittifakın en önemli aktörleri ise PKK'nın siyasi uzantısı HDP ve Gülen Örgütü oldu. Özellikle Fethullah Gülen'in ses kayıtlarında Pensilvanya'ya hürmetler gönderen ve Gülen'e övgüler yağdıran Aydın Doğan, Paralel Örgüt'e vurulan her darbede ortalığı ayağa kaldırdı.