1- İstihbarat Faaliyetleri: Sonraki aşamalarda ihtiyaç duyulacak bilgilerin toplanması, fişleme, mühimmatın dağıtılması ve tüm istihbarat çalışmaları.
2- Askeri müdahale için zemin hazırlama süreci: Balyoz yapılanmasının, askeri bir müdahale için öncelikle ülkeyi günden güne kaos ve kargaşa ortamına çekerek ortamı şekillendirmeyi planladığı, bu amaçla ORAJ, SUGA, ÇARŞAF, SAKAL Eylem Planlarını hazırladığı görülmektedir.
3- Askeri müdahale: Ortam sağlandıktan sonra yapılanma önce sıkıyönetim ilan edecek, askeri bir müdahale ile hükümeti indirip, kurumlara TSK personelini atayacak.
4- Milli Mutabakat Hükümeti dönemi (Yeniden Yapılandırma): Yürütme Milli Mutabakat Hükümeti'ne bırakılacak ve bu hükümet de cunta tarafından belirlenen programı uygulayacak. Yine kritik noktalara askerler yerleştirilecek.
5- Seçim: Milli Mutabakat hükümetince şekillendirilen devlet yapısı bu haliyle kontrol altına alınmış olacak.