16 Aralık'ta ilk duruşması yapılacak olan Balyoz Darbe Planı iddianamesinde ismi geçen 3 generalden Tümgeneral Halil Helvacıoğlu korgeneral rütbesindeki Jandarma Değerlendirme ve Denetlenme Başkanlığı'nda, Tümgeneral Gürbüz Kaya korgeneral rütbesi ile yürütülen Harita Genel Komutan Vekilliği'nde, Tuğamiral Abdullah Gavremoğlu ise tümamirallerin görevlendirildiği Deniz Kuvvetleri Personel Başkanlığı'nda vekaleten görevlendirildi. 3 general 24 Ağustos'ta AYİM'ye başvurarak, kendilerine haksızlık yapıldığı iddiasında bulunmuştu. Mahkeme de ekim ayında verdiği kararda üç komutanı terfi ettirmiş, uygulanması için de 30 Kasım'a kadar süre vermişti.
