VakIf üniversitelerini de kapsayan yeni yasaya göre, üniversiteler kendi öğrencisine burs veremeyecek. 6 Mart 2004 tarihli Resmi Gazete'de yayınlanan kanun gereği hükümet meclisten geçirdiği yasayla, tüm kamu kurum ve kuruluşları, devlet bütçesinden para alan tüm kurumlar ve benzeri kuruluşların yükseköğrenim öğrencilerine burs, kredi ve nakli yardım adı altında para vermesini yasakladı. Bu kurum ve kuruluşlar burs ve kredi verilmesini öngördükleri öğrencisini Yüksek Öğretim Kredi ve Yurtlar Kurumu'na bildirip burs meblağını önceden yatıracak. Kanun yeni verilecek burslara bu düzeni getirirken, halen devam eden burslarda doğrudan ödeme yapılma işlemi sürecek, ancak burs verilen öğrencilerin tüm kimlik bilgileri ödemelerden 60 gün önce yine Yurtlar Kurumuna bildirilecek. Kanunun bu zorlaması sadece vakıf üniversitelerini değil "Bütçeden pay alan" kurumlarında doğrudan burs vermesini yasaklıyor. Bu düzenlemede İTÜ, ODTÜ gibi köklü devlet üniversitelerin burs vermesini de engelliyor. Bu konulardaki düzenlemelerde belediyeler muaf tutuluyor.